Problèmes de pratique statistique

Problèmes de pratique statistique

Ecologie des communautés - Ecosystèmes

[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/pps2.html Version : 09.12.14]



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 Ref : pps053 Taille : 2098 ko  Version : 19.02.17 (2788 jours)

Végétation de la plaine de la Mafragh

Avec texttt{data(mafragh)} on obtient un ensemble de données représentatif des enquêtes phyto-écologiques à vocation d'aménagement. Un archétype souvent cité sur ce site et dans la documentation du paquet ade4.



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 Ref : pps078 Taille : 130 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

La valeur typologique des groupes faunistiques : ça se mesure ?

La question est sous-jacente aux données publiées par L. Friday The diversity of macro invertebrate and macrophyte communities in ponds. Freshwater Biology, 18, 87-104, 1987.


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 Ref : pps070 Taille : 275 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Richesse de l'avifaune, taille des îles et densité des singes

Cyril Barnier (M2 oMIV 2006) propose d'étudier les données disponibles dans les archives de l'ESA associées à l'article de Kenneth J. Feeley et John W. Terborgh (Habitat fragmentation and the indirect effects of herbivore (howler monkey) abundances on bird species richness. Ecology 2006, 87:144-150).


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 Ref : pps056 Taille : 203 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Structure des communautés aviaires de lacs du Nord-Est des Etats-Unis

208 sites, 95 espèces d'Oiseaux, 12 variables environnementales : Julien de Bortoli (Master OMIV 2004-2005) propose de visiter les données diffusées sur le site de l'United States Environmental Protection Agency .



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 Ref : pps003 Taille : 2041 ko  Version : 23.02.17 (2785 jours)

Macrofaune et annexes d'un fleuve

En souvenir des travaux de Monique Coulet, un difficile problème de liaison entre cortèges faunistiques et variables explicatives, soit expérimentales soit environnementales.


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 Ref : pps012 Taille : 372 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Lézards des îles de la mer de Cortés

20 espèces (Case 1983 in Manly 1995) sont présentes dans 25 îles : le problème des matrices nulles est posé (difficile).



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 Ref : pps013 Taille : 270 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Cube de données au lac du Brévent

Le lac du Brévent, situé à 2127 m d'altitude, a été étudié par Jean-Michel Chacornac (1985, 1986). Dans la thèse de l'auteur on trouve un ensemble complet de mesures temps-profondeur-descripteurs. Peut servir une réflexion sur la représentation graphique des cubes de données.


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 Ref : pps014 Taille : 159 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Expertise écologique d'un hydrosystème

Couple de tableaux biologique et écologique proposé et documenté par Ph. Usseglio-Polatera. Evolution d'un cortège faunistique ? Sa signification biologique ? (difficile)


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 Ref : pps016 Taille : 186 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Petits lacs en Alberta

Un couple classique de tableaux écologiques de Robinson, C. L. K., and W. M. Tonn (1989). 42 lacs, 11 espèces de poissons, 8 variables de milieu.


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 Ref : pps017 Taille : 218 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Cube de données au lac de la Sorme

12 dates d'échantillonnage, 10 stations et 10 variables physico-chimiques sur un réservoire artificiel.


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 Ref : pps025 Taille : 134 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Synchronisme et Gardons

Publiés par Grenouillet et al. (2001), deux tableaux petits par la taille mais contenant un travail considérable. 11 ans, 4 sites et 2 mesures.


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 Ref : pps027 Taille : 294 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Espace-Temps-Faune dans un estuaire

Eric Baran propose 95 échantillons de 39 espèces sur 6 périodes et 4 stations dans l'estuaire de la Fatala. Une question écologique originale dans \texttt{data(baran95)}.



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 Ref : pps029 Taille : 178 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Traits biologiques et traits écologiques

Une classe d?informations écologiques à laquelle introduit un grand ensemble de 17 traits sur 131 espèces d'insectes aquatiques publié par B. Statzner et al. (1997) et disponible dans \texttt{data(bsetal97)}. Comment mesurer la redondance dans ce type d'information ?


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 Ref : pps031 Taille : 291 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Similarités le long de la rivière Willamette

Une illustration rapportée dans J. Van Sickle (1997). Une matrice de similarités suffit-elle à caractériser une variabilité spatiale ?


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 Ref : pps034 Taille : 467 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Piégeages lumineux

49 nuits, 11 variables météorologiques, 17 espèces de Trichoptères. Un problème classique de couplage de tableaux. Données de Philippe Usseglio-Polatera dans \texttt{data(trichometeo)}.


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 Ref : pps035 Taille : 208 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Deux saisons sur le Buëch

Deux fois la même mesure de 10 variables sur 31 stations, par F. Vespini. Carte de l?évolution ou évolution de la carte ?


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 Ref : pps038 Taille : 289 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Avifaune de montagne

98 espèces d'oiseaux dans 376 points d'écoute entre 600 et 3000 m, 11 variables environnementales et 6 traits biologiques : un ensemble remarquable de données proposées par H. Tournier et Ph. Lebreton. Méthodes statistiques au service des données ou données biologiques comme illustration des méthodes ? Dans data(tarentaise) les deux sont possibles.


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 Ref : pps039 Taille : 306 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Acariens Oribates

Une copie dans le paquet ade4 (data(oribatid)) des données proposées par P. Legendre et D. Borcard (\url{http://www.bio.umontreal.ca/Casgrain/fr/labo/oribates.html}). Pour une introduction aux difficiles questions de relations entre tableaux dans une contrainte spatiale commune.


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 Ref : pps040 Taille : 124 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Bordure d'étang

Un relevé linéaire de J.C. Felzines (1977). Partition, gradient, écailles ? Pour apprendre à faire sortir les modèles des données.


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 Ref : pps047 Taille : 183 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Ichtyofaune du bassin du Doubs

En souvenir de la thèse de Jean Verneaux (1973), une partie des données révisées par l?auteur est disponible par data(jv73). Pour poser la question de l?ordination simultanée.


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 Ref : pps048 Taille : 380 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Avifaune des Albères

182 relevés portant sur 51 espèces ont permis à R. Prodon et J.D. Lebreton (1981) de poser une des bases statistiques de l?étude du lien entre avifaune et structure de la végétation. Dans data(rpjdl)


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 Ref : pps050 Taille : 111 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Poissons de l'Afrique de l'Ouest

Une base de données (data(westafrica)) proposée par B. Hugueny dans le but de caractériser le lien entre distances entre communautés et voisinages dans l'espace. Ordination ou classification ?


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 Ref : pps051 Taille : 149 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Avifaune de la plaine de Jons

Avec data(avijons) on dispose de 91 relevés spatialisés d?avifaune : quelle structure spatiale apparaît dans la dispersion des oiseaux ?


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 Ref : pps052 Taille : 119 ko  Version : 27.09.13 (4030 jours)

Insularité et communautés d'oiseaux

J. Blondel et B. Frochot (Blondel et al. 1988) ont collecté les données accessibles par data(avimedi). Elles posent de sérieuses questions sur les techniques d'ordination sous contraintes.

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