Courbes de réponse

Courbes de réponse

Pour ajuster des courbes à des résultats expérimentaux. L'estimation non linéaire aux moindres carrés.

[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/tdr4.html Version : 18.09.12]



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 Ref : tdr46 Taille : 758 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Régression non linéaire

Estimation d'un paramètre par régression non-linéaire : la fonction nlm (non-linear minimization). Le piège des minima locaux, le piège des mesas. Exemple de la courbe de croissance de Staphylococus aureus. Exemple du taux de croissance d'Escherichia coli en fonction de la température. Régions de confiance pour la valeur des paramètres.



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 Ref : tdr47 Taille : 678 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Le modèle de Michaelis-Menten

Ajustement par régression non-linéaire du modèle de Michaelis-Menten aux données de Michaelis et Menten.



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 Ref : tdr48 Taille : 391 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Ajustement du modèle de croissance de Monod aux données de Monod

Ajustement par intégration numérique et régression non-linéaire du modèle de croissance de Monod aux données de Monod.



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 Ref : tdr49 Taille : 326 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Ajustement du modèle de croissance logistique aux données de Verhulst

Ajustement par régression non-linéaire du modèle de croissance de Verhulst aux données de Verhulst.



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 Ref : tdr4a Taille : 1681 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Ajustement au modèle de Lotka-Volterra

Les données d'Umberto D'Ancona sur la fréquence de sélaciens dans l'Adriatique pendant la première guerre mondiale. Les données sur la densité des populations de lynx dans la région de la rivière MacKenzie pendant 114 ans. Les données sur la densité des tâches polaires pendant 249 ans. Le fameux jeu de données sur les lièvres et les lynx pendant 9 ans, en cours d'élucidation.



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 Ref : tdr411 Taille : 5594 ko  Version : 10.07.14 (9 jours)

Sélection de modèles pour la création d'un thermomètre moléculaire protéique

Illustration des méthodes de sélection de modèle en régréssion linéaire pour construire un modèle prédisant au mieux la température de croissance des procaryotes à partir de la composition en acide-aminés de leur protéome. Le critère AIC et le critère BIC.



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 Ref : tdr41 Taille : 227 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Moules

Introduction élémentaire


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 Ref : tdr42 Taille : 191 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Modèles exponentiels

Estimation des modèles non linéaires. Approche pratique.


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 Ref : tdr43 Taille : 286 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Modèles logistiques

La fiche propose un exercice pour apprendre à ajuster une courbe logistique à des observations. La classe des modèle selfStart.


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 Ref : tdr44 Taille : 423 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

ADN fécal et comptage de coyotes

Étude d'un problème ouvert


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 Ref : tdr45 Taille : 249 ko  Version : 27.09.13 (295 jours)

Le serveur d'ADE-4

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