Problèmes de pratique statistique

Problèmes de pratique statistique

Biologie évolutive

[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/pps1.html Version : 09.12.14]



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 Ref : pps074 Taille : 263 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Mesurer la diversité taxonomique de l'avifaune de la Réserve Naturelle des Ramières

Données présentées par Romain Bertrand (M2 ABEEB 2006) : comment mesurer la diversité en tenant compte de la taxonomie d'un cortège faunistique ?



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 Ref : pps071 Taille : 119 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

La compilation de Morgan Ernest sur les traits d'histoire de vie des mammifères euthériens

Olivier Delaigue (M2 oMIV 2006) nous fait connaître la base de données proposée dans les archives de l'ESA par S. K. Morgan Ernest (2003. Life History Characteristics of Non-Volant Placental mammals. Ecology 84:3401. Ecological Archives E084-093).


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 Ref : pps023 Taille : 254 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Chili, Californie, Bourgogne, Provence : communautés d'oiseaux

Avec \textt{data(ecomor)} dans le paquet ade4, on obtient un objet complexe qui pose des questions statistiques difficiles. C'est une transcription fidèle des données publiées par J. Blondel , F. Vuilleumier, L. F. Marcus et E. Terouanne (1984). Données disponibles par \texttt{library(ade4)}.


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 Ref : pps026 Taille : 169 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Galabiose et phylogénie des Oiseaux

Pour réfléchir sur la signification statististique et la sigification biologique en partant d'un extraordinaire article de N. Suzuki, M. Laskowski et Y.C. Lee (2004).


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 Ref : pps032 Taille : 197 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Oiseaux, végétation et trajectoires convergentes

89 espèces / 5 régions / 6 stades de succession forestière. Une structure de données très particulière à découvrir. Un problème de biogéographie initié par J. Blondel d'essence statistique.


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 Ref : pps037 Taille : 170 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Longévité et fidélité : chez les Pétrels et les Albatros

13 espèces et leur phylogénie dans \texttt{data(procella)}. Liaison entre 4 traits d'histoire de vie. Un problème difficile posé dans un travail de J. Bried, D. Pontier et P. Jouventin (2002).



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 Ref : pps059 Taille : 127 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Masse corporelle et style alimentaire

Gilles Bourgoin - M2 - EEB - 2005 propose une étude de liens entre traits biologiques sous contrainte phylogénétique décrits dans Pérez-Barbería, F. J., and I. J. Gordon. 1999. The relative roles of phylogeny, body size and feeding style on the activity time of temperate ruminants: a reanalysis. Pour débuter : comment on teste le lien entre une phylogénie et un trait qualitatif ?


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 Ref : pps061 Taille : 140 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Régime alimentaire et morphométrie des poissons de l'Amazonie bolivienne

Esther Hubert (M2 - EEB - 2005) nous invite à découvrir les données éditées dans Pouilly, M., F. Lino, J.-G. Bretenoux, and C. Rosales. 2003. Dietary-morphological relationships in a fish assemblage of the Bolivian Amazonian floodplain. \textit{Journal of Fish Biology} \textbf{62}:1137-1158. Un beau problème de couplage de deux tableaux biologiques.


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 Ref : pps062 Taille : 289 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Gaufres et poux : Coévolution hôtes-parasites et couplage de phylogénies

Sabine Patot (M2 - EEB - 2005) présente l'article de Legendre, P., Y. Desdevises, and E. Bazin. 2002. A statistical test for host-parasite coevolution. Systematic Biology 51:217-234. Un cas d'école de description statistique des structures biologiques.


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 Ref : pps063 Taille : 167 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Lacertidés : tableaux de traits et phylogénies

Périnne Pelosse (M2 - EEB - 2005) décrit les données publiées par Dirk Bauwens et Ramón Díaz-Uriarte de 1997 : 'Covariation of life-history traits in Lacertid lizards: a comparative study.' (American Naturalist 149:91-111). Sait-on faire des ACP sous contrainte phylogénétique ? A utiliser avec data(lizards).

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