Biologie et Modélisation

Biologie et Modélisation

Une initiation en licence. Deux champs complémentaires sont abordés : l'analyse statistique de données écologiques et la modélisation mathématique. Les deux champs intègrent les enseignements de statistique et de modélisation par l'utilisation du logiciel R. L'analyse statistique des données porte sur les statistiques descriptives et les représentations graphiques. Les tests d'hypothèses sont abordés par des méthodes de simulation. La modélisation est une introduction à l'étude de systèmes dynamiques en temps discret et continu illustrés avec des exemples principalement tirés de la biologie des populations. Vous trouverez ici les supports de cours, voir aussi les les fiches de TD et les annales.

[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/coursBEM.html Version : 27.09.12]



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 Ref : bem-genomique Taille : 627 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Biologie et Modélisation - Bio \& Mod

Rappels de génétique


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 Ref : lang01 Taille : 389 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Une brève histoire de S et de R.

Le langage S, le logiciel R, la licence GNU


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 Ref : lang02 Taille : 719 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Introduction et éléments de base.

Premiers pas - Manipuler des données - Graphiques - Obtenir de l'aide - Les paquets (packages) R.



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 Ref : lang03 Taille : 644 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Les bases du langage.

Objets: exemples et classes. Fonctions : blocs, arguments, abréviations des arguments, portée des variables. Vecteurs : exemples et modes d'indexation. Matrices et tableaux. Facteurs. Listes. Data.frame. Structures de contrôles. Boucles implicites.



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 Ref : lang04 Taille : 3146 ko  Version : 15.02.14 (209 jours)

Les graphiques de base.

les principales représentations graphiques que l'on peut obtenir avec les fonctions graphiques de haut niveau de R.



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 Ref : lang05 Taille : 245 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Tests d'hypothèses.

Introduction. Risques de première et seconde espèce. Degrés de liberté.


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 Ref : bem-vraisemblance Taille : 470 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Biologie et Modélisation - Bio \& Mod

Notion de vraisemblance et inférence bayesienne


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 Ref : bem-bioinfo Taille : 3317 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Biologie et Modélisation - Bio \& Mod

Quelques problemes de bioinformatique


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 Ref : biomod-a Taille : 230 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Biologie et Modélisation - Bio \& Mod

Introduction à la modélisation


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 Ref : biomod-b Taille : 602 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Biologie et Modélisation - Bio \& Mod

Premier cours de Biologie et Modélisation: systèmes continus


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 Ref : biomod-c Taille : 10087 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Biologie et Modélisation - Bio \& Mod

Deuxième cours de Biologie et Modélisation: Systèmes discrets


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 Ref : biomod-d Taille : 834 ko  Version : 27.09.13 (350 jours)

Biologie et Modélisation - Bio \& Mod

Troisième cours de Biologie et Modélisation: Modèles matriciels

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