Biologie et Modélisation

Biologie et Modélisation

Une initiation en licence. Deux champs complémentaires sont abordés : l'analyse statistique de données écologiques et la modélisation mathématique. Les deux champs intègrent les enseignements de statistique et de modélisation par l'utilisation du logiciel R. L'analyse statistique des données porte sur les statistiques descriptives et les représentations graphiques. Les tests d'hypothèses sont abordés par des méthodes de simulation. La modélisation est une introduction à l'étude de systèmes dynamiques en temps discret et continu illustrés avec des exemples principalement tirés de la biologie des populations. Vous trouverez ici les fiches de TD, voir aussi les les cours et les annales.

[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/tdr10.html Version : 14.10.17]



 telecharger le pdf

 Ref : bem1 Taille : 937 ko  Version : 15.02.24 (18 jours)

Biologie et Modélisation - Introduction au logiciel Rlogo{}

La fiche donne des indications pratiques très simples pour accéder au logiciel de statistique Rlogo{}.



 telecharger le pdf

 Ref : bem2 Taille : 1100 ko  Version : 07.10.20 (1244 jours)

Des fleurs et des mannequins

Comment se familiariser avec le logiciel Rlogo{}



 telecharger le pdf

 Ref : bem3 Taille : 1987 ko  Version : 25.09.16 (2717 jours)

De la stature chez l'Hommeldots à la taille des cerveaux chez les mammifères. Réversion, régression, corrélation

Comment se familiariser avec le logiciel Rlogo{}



 telecharger le pdf

 Ref : bem4 Taille : 618 ko  Version : 29.09.21 (887 jours)

L'énigme de la valeur C

Quelques exercices de manipulation et de représentation graphique des données. La valeur C représente la taille du génome. Elle est mesurée le plus souvent en pico-grammes (pg), ou encore en nombre de paires de bases nucléotidiques. On pourrait lui supposer un lien a priori avec la complexité morphologique des organismes. Cette fiche propose de voir ce qu'il en est exactement.



 telecharger le pdf

 Ref : bem5 Taille : 1932 ko  Version : 06.10.21 (880 jours)

Des électeurs, des boules, des cercles, des étudiants satisfaits

Le calcul des probabilités parle de l'échantillon à partir de la population. La statistique inférentielle parle de la population à partir d'un échantillon. Quelques illustrations.



 telecharger le pdf

 Ref : bem11 Taille : 399 ko  Version : 16.10.17 (2332 jours)

Des bébés en avance : Manipulation et analyse de données

Le but de ce TP est de vous placer (un peu plus) dans la peau d'un vrai statisticien. Contrairement à ce qu'on vous a fait croire jusqu'à maintenant, la majorité des jeu de données que vous aurez à traiter plus tard ne sont jamais aussi bien frquote{rangés}. La première partie de ce TP consiste donc à apprendre à nettoyer un jeu de données. Les données sont extraites d'une étude réalisée au Duke University Medical Center à Durham aux États-Unis qui recense les naissances de 671 grands prématurés entre 1981 et 1987, pour lesquels de nombreuses variables ont été relevées.


 telecharger le pdf

 Ref : bem6 Taille : 262 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Analyse des systèmes dynamiques : Modèles continus

Systèmes dynamiques dans $mathbb{R}$, introduction à maple pour l'analyse qualitative, utilisation de Rlogo{} pour l'étude des solutions et l'ajustement à des jeux de données



 telecharger le pdf

 Ref : bem7 Taille : 3418 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Analyse des systèmes dynamiques : modèles discrets

Systèmes dynamiques discrets dans $mathbb{R}$, utilisation de Rlogo{} et de maple.



 telecharger le pdf

 Ref : bem8 Taille : 339 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Simulation de la dynamique d'une population - Modèles récurrents

La suite de Fibonacci. Le modèle exponentiel. Le modèle logistique. Un modèle avec deux classes d'âge. Un modèle avec deux catégories de population. Un modèle avec deux populations en interaction.



 telecharger le pdf

 Ref : bem9 Taille : 319 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Sélection et Dérive Génétique

Simulation de l'évolution des fréquences allèliques d'un locus sous l'effet de la dérive génétique et de la sélection.



 telecharger le pdf

 Ref : bem10 Taille : 319 ko  Version : 27.09.13 (3811 jours)

Modèles discrets - Populations structurées

Les matrices de Leslie. Un modèle avec deux classes d'âge. Un modèle avec deux catégories de population. Un modèle matriciel complexe.


logo UCBL logo UCBL logo UCBL